从后把叶出现到植株完全停止生长，叶片大部枯黄，藕身肥大充实为止，为结藕期。

莲藕后把叶出现后，莲鞭先端由先前的水平方向伸长转向斜下方生长，节间增粗，节数增加，开始形成新藕。莲藕结藕的时期，因品种、栽培方式和环境条件的不同而不同，一般是早熟品种比晚熟品种结藕早，浅水比深水结藕早，南方比北方结藕早，藕莲比子莲结藕早。子莲主要产品是莲子，养分消耗多，故其所结藕较小，且多不能食用。藕身基本定型后，可以采收嫩藕，但要使其充分成熟，则需要等到地上叶枯黄时。

莲藕在地下主茎和分枝陆续结藕的同时，地上部分也相应陆续开花结实。开花、结实的多少因品种和生态环境的不同而异，少数早熟藕品种甚至不开花。每一朵花从开花、受粉、受精到莲子成熟，大约需要30～40天的时间。荷花虽然为两性花，但由于每一朵花中雌蕊先成熟，雄蕊后成熟，所以多不能自花授粉，而必须借助蜜蜂等昆虫以及风进行异花授粉，才能结实良好。